产品升级!抗性宏基因组又增添新成员:毒力基因VFDB-2024版

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凌恩明星产品

抗性宏基因组

内容又增加啦!

注释数据库增添新成员——

毒力因子VFDB注释-2024版

VFDB数据库全称为Virulence Factors of Pathogenic Bacteria,用于专门研究致病细菌、衣原体和支原体致病因子的数据库。来源于微生物,并对微生物自身侵染和引起特定宿主疾病具有促进作用的物质称为毒力因子(virulent factor),主要包括细菌毒素、调节细菌粘附作用的细胞表面蛋白、对细菌本身具有保护作用的蛋白、细胞表面碳水化合物以及具有细菌致病性的水解酶等。

本次更新的VFDB数据库(2024版本)包含了共约2.8w个毒力因子,具体可分为14个大类,即黏附(Adherence)、外源毒素(Exotoxin)、入侵(Invasion)、效应因子传输系统(Effector Delivery System)、免疫调控(Immune Modulation)、运动(Motility)、外泌酶(Exoenzyme)、生存压力(Stress Survival)、生物膜(Biofilm)、抗菌活性/竞争优势(Antimicrobial activity/Competitive advantage)等。

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图 VFDB数据库分类

“同一健康”(One Health)理念下,环境中的抗性基因、毒力基因、可移动元件等都会流通、转移,因此,不同环境中抗性基因的传播非常值得关注!(32+综述!从One Health角度来谈新污染物对全球健康的影响)

凌恩抗性宏基因组注释数据库进一步汇总升级

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全方位注释挖掘样本中的抗性基因

关注环境/医学临床样本中

抗性基因的传播与转移机制

目前凌恩抗性宏基因组项目报告不仅包含抗性基因的多样性、丰度和分布模式,还能获得包括抗性组变化驱动因素、指示基因识别、抗性组变化分子机制、抗性基因风险排序、临床抗性基因分析等在内的一系列深入研究结果,十二大分析模块,超50+分析内容,能够满足广大科研工作者的需求。分析及作图可直接用于文章发表。

本次全新升级的

宏基因组抗性基因分析流程

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整个分析方案共包含12大类

共计超过50的分析内容!

部分分析结果展示

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